Biostar B560MX-E Pro выполнена в форм-факторе Micro-ATX с габаритами 244 × 244 мм. Материнская плата предназначена для построения относительно компактных настольных компьютеров на аппаратной платформе Intel.

Задействован набор логики Intel B560. Допускается установка процессоров Core десятого и одиннадцатого поколений в исполнении LGA1200. Для модулей оперативной памяти DDR4-2933/2800/2666/2400/2133 есть четыре разъёма: максимально поддерживаемый объём ОЗУ составляет 128 Гбайт.

Плата располагает четырьмя стандартными портами SATA 3.0 для подключения накопителей. Кроме того, есть два коннектора М.2 для твердотельных модулей с интерфейсом PCIe.

За возможности расширения отвечают слоты PCIe 3.0 x1, PCIe 4.0 x16 и PCIe 3.0 x16. Плата B560MX-E Pro снабжена звуковым кодеком ALC897 формата 7.1, гигабитным сетевым контроллером, а также может быть дополнена адаптером беспроводной связи Wi-Fi и Bluetooth.

Интерфейсный блок содержит разъём PS/2 для клавиатуры/мыши, коннекторы D-Sub, DVI и HDMI, четыре порта USB 3.2 Gen1 и два порта USB 2.0, гнездо для сетевого кабеля и набор аудиогнёзд.